In de loop der tijd zijn er diverse restauraties geweest aan de Sint Jan. Met de eerste restauratie zijn ze zeven en tachtig jaar bezig geweest en startte in 1859. De tweede restauratie heeft vierentwintig jaar geduurd, waar ze 1961 met de werkzaamheden zijn gestart. Omdat er ernstige verwering werd geconstateerd is men wederom begonnen met een restauratie in 1998, deze werd op zaterdag 2 en zondag 3 april 2011 feestelijk afgesloten. Bij de derde restauratie wordt er veelal gebruik gemaakt van de nieuwe technieken. De restauraties zijn zeer nauwkeurig en er worden vele moeilijke beslissingen genomen onder andere omtrent de steen keuze om de Sint Jan zijn oorspronkelijke opbouw en uiterlijk te laten behouden.
